Sevgili üyelerimiz,

​Aşağıda detaylı şekilde eğitim konuları, süreleri ve detaylı içerikleri yer almaktadır:

​

​        Sanger Dizileme ile Tür Tespiti, Filogenetik Ağaç Çizimi ve Veri Yorumlama

       Eğitim Süresi: 4 gün 

       WetLab Uygulama: 2 gün

• DNA İzolasyonu

• Nanospektrofotometrik Ölçüm

• Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme

• PCR Analizi (Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme)

• Sanger Dizilemeye Hazırlık Prosedürlerinin Tamamlanması

• Ham Veri Eldesi

         Biyoinformatik Uygulama: 2 gün

• MEGA programı üzerinden DNA barkod verisini yorumlama, filogenetik ağaç çizme, parametrelerini anlama ve uygulama.

• Veri Yorumlama.

 

       Tüm Genom Dizileme (WGS) ve Verinin Biyoinformatik Analizlerle Anlamlandırılması

       Eğitim Süresi: 4-5 gün

       WetLab Uygulama: 2 gün

• DNA İzolasyonu

• NanoDrop ve Qubit ile DNA Konsantrasyonunun Ölçülmesi

• Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme

• Kütüphane Hazırlama

• Bioanlyzer ile Kütüphane Fragmentlerinin Tespiti

• Yeni Nesil Dizileme Cihazlarının Tanıtılması ve Dizileme Teknolojilerinin Kullanımı Hakkında Bilgi Verilmesi

       Biyoinformatik Uygulama: 2 -3 gün

• Biyoinformatiğin Tanımı ve Uygulamaları (Veterinerlikte Kullanımı)

• Veri Türleri ve Veri Formatları

• Veritabanları ve Araçlar

• Veri Kalitesi Kontrolü

• Hizalama (Alignment)

• Dosyaların İşlenmesi

• Variant Calling (DNA dizisindeki tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) belirlemek)

• Varyant Filtrasyonu ve Anotasyonu

• Assembly

• Assembly Kalitesi Değerlendirme

• Gen Anotasyonu

• Antimikrobiyal Direnç ve Virülens Gen Analizi

• Sonuçların Görselleştirilmesi ve Raporlama

 

      Tüm Transkriptom Dizileme (WTS) ve Verinin Biyoinformatik Analizlerle Anlamlandırılması

      Eğitim Süresi: 4-5 gün

      WetLab Uygulama: 2 gün

• RNA İzolasyonu

• NanoDrop ve Qubit ile RNA Konsantrasyonunun Ölçülmesi

• Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme

• Kütüphane Hazırlama

• Bioanlyzer ile Kütüphane Fragmentlerinin Tespiti

• Yeni Nesil Dizileme Cihazlarının Tanıtılması ve Dizileme Teknolojilerinin Kullanımı Hakkında Bilgi Verilmesi

       Biyoinformatik Uygulama: 2 -3 gün

• Biyoinformatiğin Tanımı ve Uygulamaları (Veterinerlikte Kullanımı)

• Veri Türleri ve Veri Formatları

• Veritabanları ve Araçlar

• Veri Kalitesi Kontrolü

• Hizalama (Alignment)

• Dosyaların İşlenmesi

• Transkript Sayımı ve Ekspresyon Analizi

• Transkript Keşfi ve Anotasyonu

• Fonksiyonel Anotasyon ve Zenginleştirme Analizi

• Sonuçların Görselleştirilmesi ve Raporlama

 

       Metabarkodlama Analizi ve Verinin Biyoinformatik Analizlerle Anlamlandırılması

       Eğitim Süresi: 4-5 gün

       WetLab Uygulama: 2 gün

• DNA İzolasyonu

• NanoDrop ve Qubit ile DNA Konsantrasyonunun Ölçülmesi

• Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme

• PCR Analizi

• Kütüphane Hazırlama

• Bioanlyzer ile Kütüphane Fragmentlerinin Tespiti

• Yeni Nesil Dizileme Cihazlarının Tanıtılması ve Dizileme Teknolojilerinin Kullanımı Hakkında Bilgi Verilmesi

       Biyoinformatik Uygulama: 2 -3 gün

• Biyoinformatiğin Tanımı ve Uygulamaları (Veterinerlikte Kullanımı)

• Veri Türleri ve Veri Formatları

• Veritabanları ve Araçlar

• Veri Kalitesi Kontrolü

• Hizalama (Alignment)

• Dosyaların İşlenmesi

• Verilerin Veri tabanları ile Eşleştirilmesi

• Alfa (Shannon, Simpson) ve Beta çeşitlilik

• Sonuçların Görselleştirilmesi ve Raporlama

 

       Metagenomik Analizi ve Verinin Biyoinformatik Analizlerle Anlamlandırılması

       Eğitim Süresi: 4-5 gün

       WetLab Uygulama: 2 gün

• DNA İzolasyonu

• NanoDrop ve Qubit ile DNA Konsantrasyonunun Ölçülmesi

• Agaroz Jel Hazırlama ve Yürütme

• Kütüphane Hazırlama

• Bioanlyzer ile Kütüphane Fragmentlerinin Tespiti

• Yeni Nesil Dizileme Cihazlarının Tanıtılması ve Dizileme Teknolojilerinin Kullanımı Hakkında Bilgi Verilmesi

       Biyoinformatik Uygulama: 2 -3 gün

• Biyoinformatiğin Tanımı ve Uygulamaları (Veterinerlikte Kullanımı)

• Veri Türleri ve Veri Formatları

• Veritabanları ve Araçlar

• Veri Kalitesi Kontrolü

• Hizalama (Alignment)

• Dosyaların İşlenmesi

• Variant Calling (DNA dizisindeki tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) belirlemek)

• Varyant Filtrasyonu ve Anotasyonu

• Assembly

• Assembly Kalitesi Değerlendirme

• Antimikrobiyal Direnç ve Virülens Gen Analizi

• Fonksiyonel Analiz

• Sonuçların Görselleştirilmesi ve Raporlama​

 

         

​